Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc97Q9DBT3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms