Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Swt1Q9DBQ9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms