Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med29Q9DB91 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 317.7 ms