Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms