Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB20

Atp5o, ATP synthase subunit O, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5oQ9DB20 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5oQ9DB20 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms