Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAX3

Erv3, Endogenous retroviral sequence 3, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erv3Q9DAX3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Erv3Q9DAX3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Erv3Q9DAX3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Erv3Q9DAX3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Erv3Q9DAX3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Erv3Q9DAX3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Erv3Q9DAX3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Erv3Q9DAX3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Erv3Q9DAX3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Erv3Q9DAX3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Erv3Q9DAX3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Erv3Q9DAX3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Erv3Q9DAX3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Erv3Q9DAX3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Erv3Q9DAX3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Erv3Q9DAX3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Erv3Q9DAX3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Erv3Q9DAX3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Erv3Q9DAX3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Erv3Q9DAX3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Erv3Q9DAX3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Erv3Q9DAX3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Erv3Q9DAX3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Erv3Q9DAX3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Erv3Q9DAX3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Erv3Q9DAX3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Erv3Q9DAX3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Erv3Q9DAX3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Erv3Q9DAX3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Erv3Q9DAX3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Erv3Q9DAX3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Erv3Q9DAX3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Erv3Q9DAX3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms