Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK2

Pacrg, Parkin coregulated gene protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PacrgQ9DAK2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PacrgQ9DAK2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms