Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms