Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms