Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H2

Cldnd2, Claudin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd2Q9D9H2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms