Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Speer4bQ9D9F7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Speer4bQ9D9F7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms