Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D9

Uncharacterized protein C1orf189 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9D9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D9D9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D9D9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D9D9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D9D9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D9D9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D9D9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9D9D9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms