Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmco5aQ9D9D5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms