Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U0

Ifrd2, Interferon-related developmental regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd2Q9D8U0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifrd2Q9D8U0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifrd2Q9D8U0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms