Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rexo2Q9D8S4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms