Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9D8L0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9D8L0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9D8L0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9D8L0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9D8L0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9D8L0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9D8L0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9D8L0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9D8L0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9D8L0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9D8L0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9D8L0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9D8L0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9D8L0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q9D8L0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D8L0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D8L0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D8L0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D8L0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8L0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8L0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8L0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8L0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8L0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8L0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms