Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slc52a2Q9D8F3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slc52a2Q9D8F3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc52a2Q9D8F3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc52a2Q9D8F3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc52a2Q9D8F3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc52a2Q9D8F3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc52a2Q9D8F3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc52a2Q9D8F3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc52a2Q9D8F3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc52a2Q9D8F3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc52a2Q9D8F3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc52a2Q9D8F3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc52a2Q9D8F3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc52a2Q9D8F3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc52a2Q9D8F3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc52a2Q9D8F3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc52a2Q9D8F3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc52a2Q9D8F3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc52a2Q9D8F3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc52a2Q9D8F3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc52a2Q9D8F3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc52a2Q9D8F3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc52a2Q9D8F3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc52a2Q9D8F3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc52a2Q9D8F3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc52a2Q9D8F3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc52a2Q9D8F3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc52a2Q9D8F3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc52a2Q9D8F3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc52a2Q9D8F3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc52a2Q9D8F3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc52a2Q9D8F3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc52a2Q9D8F3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc52a2Q9D8F3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc52a2Q9D8F3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc52a2Q9D8F3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc52a2Q9D8F3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc52a2Q9D8F3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms