Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fip1l1Q9D824 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms