Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Vstm5Q9D806 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Vstm5Q9D806 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Vstm5Q9D806 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Vstm5Q9D806 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Vstm5Q9D806 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm5Q9D806 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm5Q9D806 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm5Q9D806 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm5Q9D806 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm5Q9D806 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm5Q9D806 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm5Q9D806 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm5Q9D806 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm5Q9D806 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm5Q9D806 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm5Q9D806 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm5Q9D806 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm5Q9D806 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm5Q9D806 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm5Q9D806 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm5Q9D806 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm5Q9D806 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm5Q9D806 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm5Q9D806 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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