Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7X3

Dusp3, Dual specificity protein phosphatase 3, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp3Q9D7X3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dusp3Q9D7X3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dusp3Q9D7X3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dusp3Q9D7X3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dusp3Q9D7X3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dusp3Q9D7X3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dusp3Q9D7X3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dusp3Q9D7X3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Dusp3Q9D7X3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms