Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rep15Q9D7T1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rep15Q9D7T1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rep15Q9D7T1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rep15Q9D7T1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rep15Q9D7T1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rep15Q9D7T1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rep15Q9D7T1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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