Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I0

Shisa5, Protein shisa-5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa5Q9D7I0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa5Q9D7I0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms