Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klhl40Q9D783 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klhl40Q9D783 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl40Q9D783 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl40Q9D783 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl40Q9D783 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl40Q9D783 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl40Q9D783 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl40Q9D783 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl40Q9D783 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl40Q9D783 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl40Q9D783 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl40Q9D783 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl40Q9D783 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl40Q9D783 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl40Q9D783 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl40Q9D783 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms