Protein–RNA interactions for Protein: Q9D753

Exosc8, Exosome complex component RRP43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc8Q9D753 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc8Q9D753 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc8Q9D753 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc8Q9D753 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc8Q9D753 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc8Q9D753 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc8Q9D753 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc8Q9D753 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc8Q9D753 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc8Q9D753 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc8Q9D753 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc8Q9D753 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc8Q9D753 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc8Q9D753 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc8Q9D753 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc8Q9D753 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc8Q9D753 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc8Q9D753 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc8Q9D753 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc8Q9D753 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc8Q9D753 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc8Q9D753 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Exosc8Q9D753 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Exosc8Q9D753 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc8Q9D753 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms