Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms