Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Borcs6Q9D6W8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Borcs6Q9D6W8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms