Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms