Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Rab11fip1Q9D620 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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