Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5F6

4930447A16Rik, RIKEN cDNA 4930447A16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447A16RikQ9D5F6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930447A16RikQ9D5F6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930447A16RikQ9D5F6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms