Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam227bQ9D518 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms