Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D4W2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D4W2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D4W2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D4W2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D4W2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D4W2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D4W2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D4W2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q9D4W2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q9D4W2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q9D4W2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q9D4W2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q9D4W2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D4W2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D4W2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D4W2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D4W2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D4W2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D4W2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms