Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Phf6Q9D4J7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms