Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lonrf3Q9D4H7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms