Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D454 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D454 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D454 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D454 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D454 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D454 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D454 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D454 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D454 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D454 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D454 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D454 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D454 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9D454 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9D454 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9D454 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D454 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D454 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D454 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D454 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D454 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D454 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D454 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D454 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D454 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D454 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D454 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D454 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D454 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D454 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D454 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D454 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D454 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D454 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D454 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D454 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D454 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D454 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D454 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D454 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D454 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D454 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D454 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D454 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D454 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D454 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D454 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D454 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D454 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D454 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D454 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D454 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D454 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D454 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D454 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D454 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D454 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D454 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D454 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D454 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D454 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D454 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D454 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D454 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D454 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D454 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D454 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D454 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D454 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D454 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D454 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D454 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D454 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D454 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D454 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D454 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D454 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D454 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D454 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D454 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D454 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D454 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D454 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D454 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D454 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D454 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D454 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D454 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D454 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D454 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D454 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D454 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D454 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D454 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D454 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D454 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D454 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D454 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D454 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms