Protein–RNA interactions for Protein: Q9D300

Rasgef1c, Ras-GEF domain-containing family member 1C, mousemouse

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Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1cQ9D300 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rasgef1cQ9D300 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rasgef1cQ9D300 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rasgef1cQ9D300 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rasgef1cQ9D300 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rasgef1cQ9D300 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rasgef1cQ9D300 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rasgef1cQ9D300 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rasgef1cQ9D300 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rasgef1cQ9D300 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rasgef1cQ9D300 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rasgef1cQ9D300 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Rasgef1cQ9D300 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Rasgef1cQ9D300 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Rasgef1cQ9D300 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Rasgef1cQ9D300 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Rasgef1cQ9D300 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rasgef1cQ9D300 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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