Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F8

Toporsl, Topoisomerase I-binding, arginine/serine-rich-like, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ToporslQ9D2F8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ToporslQ9D2F8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ToporslQ9D2F8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ToporslQ9D2F8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ToporslQ9D2F8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ToporslQ9D2F8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ToporslQ9D2F8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ToporslQ9D2F8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ToporslQ9D2F8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ToporslQ9D2F8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ToporslQ9D2F8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ToporslQ9D2F8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ToporslQ9D2F8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ToporslQ9D2F8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ToporslQ9D2F8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ToporslQ9D2F8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ToporslQ9D2F8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ToporslQ9D2F8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ToporslQ9D2F8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ToporslQ9D2F8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ToporslQ9D2F8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ToporslQ9D2F8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ToporslQ9D2F8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms