Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms