Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chordc1Q9D1P4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chordc1Q9D1P4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chordc1Q9D1P4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chordc1Q9D1P4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Chordc1Q9D1P4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chordc1Q9D1P4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chordc1Q9D1P4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chordc1Q9D1P4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chordc1Q9D1P4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chordc1Q9D1P4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chordc1Q9D1P4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chordc1Q9D1P4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chordc1Q9D1P4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chordc1Q9D1P4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chordc1Q9D1P4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chordc1Q9D1P4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chordc1Q9D1P4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chordc1Q9D1P4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chordc1Q9D1P4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms