Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1K7

UPF0687 protein C20orf27 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1K7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9D1K7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D1K7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D1K7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D1K7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D1K7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D1K7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D1K7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms