Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms