Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E4

Cysrt1, Cysteine-rich tail protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cysrt1Q9D1E4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cysrt1Q9D1E4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms