Protein–RNA interactions for Protein: Q9D162

Ccdc167, Coiled-coil domain-containing protein 167, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc167Q9D162 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc167Q9D162 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms