Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
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Hddc3Q9D114 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hddc3Q9D114 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Hddc3Q9D114 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hddc3Q9D114 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Hddc3Q9D114 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Hddc3Q9D114 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Hddc3Q9D114 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hddc3Q9D114 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Hddc3Q9D114 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hddc3Q9D114 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hddc3Q9D114 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Hddc3Q9D114 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Hddc3Q9D114 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Hddc3Q9D114 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Hddc3Q9D114 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hddc3Q9D114 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hddc3Q9D114 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hddc3Q9D114 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hddc3Q9D114 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hddc3Q9D114 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hddc3Q9D114 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hddc3Q9D114 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hddc3Q9D114 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hddc3Q9D114 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hddc3Q9D114 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hddc3Q9D114 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hddc3Q9D114 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hddc3Q9D114 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hddc3Q9D114 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hddc3Q9D114 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hddc3Q9D114 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hddc3Q9D114 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hddc3Q9D114 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hddc3Q9D114 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hddc3Q9D114 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hddc3Q9D114 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hddc3Q9D114 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hddc3Q9D114 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hddc3Q9D114 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hddc3Q9D114 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.3 ms