Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem53Q9D0Z3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms