Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0T1

Snu13, NHP2-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snu13Q9D0T1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snu13Q9D0T1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snu13Q9D0T1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snu13Q9D0T1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snu13Q9D0T1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snu13Q9D0T1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snu13Q9D0T1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snu13Q9D0T1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snu13Q9D0T1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snu13Q9D0T1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snu13Q9D0T1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snu13Q9D0T1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snu13Q9D0T1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snu13Q9D0T1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snu13Q9D0T1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snu13Q9D0T1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snu13Q9D0T1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snu13Q9D0T1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snu13Q9D0T1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snu13Q9D0T1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snu13Q9D0T1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snu13Q9D0T1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snu13Q9D0T1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snu13Q9D0T1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snu13Q9D0T1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snu13Q9D0T1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snu13Q9D0T1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snu13Q9D0T1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snu13Q9D0T1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snu13Q9D0T1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snu13Q9D0T1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snu13Q9D0T1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snu13Q9D0T1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snu13Q9D0T1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snu13Q9D0T1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snu13Q9D0T1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snu13Q9D0T1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snu13Q9D0T1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snu13Q9D0T1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snu13Q9D0T1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snu13Q9D0T1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snu13Q9D0T1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snu13Q9D0T1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snu13Q9D0T1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snu13Q9D0T1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snu13Q9D0T1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms