Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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