Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms