Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms