Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prelid3bQ9CYY7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prelid3bQ9CYY7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prelid3bQ9CYY7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prelid3bQ9CYY7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prelid3bQ9CYY7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prelid3bQ9CYY7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prelid3bQ9CYY7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prelid3bQ9CYY7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prelid3bQ9CYY7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prelid3bQ9CYY7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prelid3bQ9CYY7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prelid3bQ9CYY7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prelid3bQ9CYY7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prelid3bQ9CYY7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prelid3bQ9CYY7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prelid3bQ9CYY7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prelid3bQ9CYY7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prelid3bQ9CYY7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prelid3bQ9CYY7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prelid3bQ9CYY7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prelid3bQ9CYY7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prelid3bQ9CYY7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prelid3bQ9CYY7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Prelid3bQ9CYY7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Prelid3bQ9CYY7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Prelid3bQ9CYY7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms