Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYQ5

Hcfc1r1, Host cell factor C1 regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcfc1r1Q9CYQ5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms